发简信
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学习笔记目录开个帖子整理一下自己的生信学习笔记目录，方便日后查看：最近更新：2022.07.03 bulk RNA-seq: 实战系列: RNA-seq入门...
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2026版scRNA-seq入门实战（一）：上游数据下载、格式转化和质控本节概览：在文章中找到GEO accession number，从NCBI获取scRNA-seq数据的SRR号在linux中使用prefetch...
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单细胞转录组测序技术完全指南：从SMART-seq2到10x Genomics——原理、工作流程、质控指标及实验设计建议单细胞转录组测序技术完全指南：从SMART-seq2到10x Genomics——原理、工作流程、质控指标及实验设计建议 本节概览 一、为什么需...
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2026版ATAC-seq入门实战（全流程汇总）：从原始数据到差异开放染色质
前言：为什么做ATAC-seq？ ATAC-seq（Assay for Transposase-Accessible Chromatin usi...
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PiggyBac 转座子系统构建 稳定过表达细胞系 流程全解析PiggyBac 转座子系统构建 稳定过表达细胞系 流程全解析 本节概览 一、PiggyBac 转座子的工作原理二、双质粒系统的组成与载体设计三...
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启动子选择指南：表达强度、稳定性与适用场景启动子选择指南：表达强度、稳定性与适用场景 本节概览一、启动子的基本作用机制二、常用组成型启动子详解三、组织特异性启动子与诱导型系统四、如何为实...
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CRISPR/Cas9构建基因敲入（Knock-in）荧光报告细胞系流程全解析——从Donor设计到细胞鉴定CRISPR/Cas9构建基因敲入（Knock-in）荧光报告细胞系流程全解析——从Donor设计到细胞鉴定 本节概览一、基因敲入的核心原理二、...
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2026版RNA-seq入门实战（十三）：转录因子富集分析 RcisTarget本节概览本流程利用 RcisTarget 包，从差异表达基因出发，系统预测调控这些基因表达变化的关键转录因子（TF），并可视化 TF‑motif...
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2026版RNA-seq入门实战（十二）：GSVA——基因集变异分析本节概览：1.GSVA简单介绍2.基因集的下载读取: 手动与msigdbr包下载3.GSVA的运行4.limma差异分析5.GSVA结果可视化：...