NTsys是一款强大的统计分析软件，具有多个统计模型组件，在植物多样性分析中经常会用到。其中最主要的模块是聚类分析，常用的方法有UPGMA、CL...
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UPGMA法聚类分析——NTsys2.10e -
GToTree做进化树
How to get phylogenetic tree from kraken or bracken output file?[https:/...
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计算分子进化-搞懂PAML的正选择分析许多基因组的文章里都会提到使用PAML进行基因的正选择分析(positive selection), 网上也有一些教程介绍如何用PAML进行分析...
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比较基因组学的研究内容
定义：在基因组序列信息已知的基础上，对已知基因和基因的结构进行比较，了解基因的功能，表达调控机制和物种进化过程（简单来说就是拿组装好的基因组做比...
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每周文献|小麦白粉病扩展与全球贸易人类活动与病原物的扩散息息相关。驯化和育种事件会加速病原物群体扩张。小麦白粉病是由白粉病真菌(Blumeria graminis f. sp. ...
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dotPlotly 比较两个不同组装的效果可视化dotPlotly[https://github.com/tpoorten/dotPlotly]工具，是利用Ｒ语言写的可视化Minimap...
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HYphy
Hyphy的官网:https://www.hyphy.org/about/ Hyphy(Hypothesis Testing using Phy...
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物种驯化起源研究参考
群体遗传中的驯化起源和基因流（基因漂移）分析是顶刊杂志最关注的亮点之一，能部分解答这方面的问题，IF应该就不会低。 这里选取几篇近几年的相关研究...
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为什么要做基因家族（前言）基因家族的概念 基因家族 : 来源于同一个祖先，由一个基因通过基因复制而产生的两个或多个拷贝而构成的一组基因，他们在结构和功能上面具有明显的相似...
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分子进化理论（11）蛋白质进化速率进化速率 进化速率既可指分子的进化速率（蛋白质或核酸等大分子中的氨基酸或核苷酸在一定时间内的替换率），也可指某一类群的物种分化速率，甚至可指特定...
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