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生物信息笔记
19篇文章 · 23526字 · 2人关注
  • Perl 读取json 数据

    **JSON (JavaScript Object Notation) 数据格式，官方的说法是“一种轻量级的数据交换格式。 易于人阅读和编写。同...

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  • Perl 一句话命令

    Perl程序一行命令，可以替代grep+sed+awk； 一行式选项-e 表示后面接perl的一行式表达式； -p 表示print操作，即对每一...

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  • RNAseq pipeline

    首先，分析RNAseq要对整个分析流程有个整体的了解：参考https://tiramisutes.github.io/2018/12/04/re...

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  • Resize,w 360,h 240
    LDA Effect Size (LEfSe) Analysis（LEfSe丰度差异分析）

    LEfSe[1]是一种用于发现高维生物标识和揭示基因组特征的软件。包括基因，代谢和分类，用于区别两个或两个以上生物条件（或者是类群）。该算法强调...

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    组间差异分析神器-STAMP | 分析技能

    在微生态研究中，当我们做完16S或宏基因组测序等多样性测序后，想找出不同处理组之间差异物种或差异基因，一般常用的组间差异分析metastats（...

    0.3 12148 2 8
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    qiime

    创建完环境后，qiime可以运行一切都很完美 在进行差异分析的时候在调用py脚本的时候，里面竟然有模块 之后发现需要在安装qiime模块才可以同...

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  • Resize,w 360,h 240
    scikit-bio模块的相关问题

    由于使用pip安装的时候，总是说没有合适的版本这个问题使用另一篇文章来解决，如果还是解决不了的话，请看看是不是这个模块的版本问题因为不同版本的改...

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  • Could not find a version that satisfies the requirement 的解决方案

    1.升级pip2.改变镜像（平时下载比较慢也可以试试这个豆瓣的镜像，真的很快）https://blog.csdn.net/weixin_4349...

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    大概是16S从实验到数据分析最全流程了吧

    原文：https://www.sohu.com/a/270075112_99971433[https://www.sohu.com/a/2700...

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