Data preparation 继续上次的内容，下载好数据后就可以正式开始鉴定了。首先回顾一下，下载好的数据。 基因组序列信息，存储基因组序列信息的.fasta文件。还有其...
IP属地：新疆
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基因家族专题(3)：基因家族成员的鉴定
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三种方法构建系统发育树 学习笔记
所用数据为一个属内不同种不同群体的叶绿体基因组序列，数量为80条。 发现用全长序列建树的时候，不适合选用太多外类群，否则ML法中会导致属内分枝的枝长特别短。原因应该是基因间隔...
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这或许是我写的最全的BLAST教程Basic local alignment search tool (BLAST) 包括：blastn, blastp, blastx, tblastn, tblastx等....
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BUSCO - 组装质量评估BUSCO - 组装质量评估软件 BUSCO - Benchmarking Universal Single-Copy Orthologs 额。直译的话就是普遍通用的单拷贝直...
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外显子、内含子、mRNA、CDS、ORF的区别与联系前言 更多内容，请访问我的 个人博客。 DNA 复制： 概念：DNA 复制：以 DNA 为模板，在 DNA 聚合酶的催化作用下，将四种游离的 dNTP 按照碱基互补配对原则合...
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如何轻松构建物种系统发育树在常规的基因组分析中，当我们对某一物种的基因组进行从头组装与注释获得其的基本信息后，通常会想知道该物种与一些其他近源物种之间的进化关系，此时就需要构建不同物种之间的系统发育树...
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转录组分析要提前了解的若干问题
1、什么是转录组测序？ 转录组广义上指在某一生理条件下，细胞内所有转录组产物的集合，包括：mRNA、ncRNA、rRNA等；狭义上指所有mRNA的集合。 转录组测序的研究对象...
