作者，Evil Genius 年底了，很多人被裁员了，有些人也与我交流，很焦虑，其实也没什么，只要有一个健康的身体，我们就还有翻盘的机会。 大家也知道，我最近也在劳动仲裁，劳...
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知识扩展--影像空间转录组数据集评估与可重复性的标准化度量体系 -
脚本测试--R版本 vs python版本的harmony整合效果比较作者，Evil Genius 总是有人说R版本的harmony整合效果优于python版本，今天我们测试一下。 首先准备数据，10X数据 我们首先测试R版本，参数设置如下： ...
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基因组 + 空间组--角质形成细胞向皮肤鳞状细胞癌的遗传演变作者，Evil Genius 现在发一篇NC也是相当不容易啊，今天我们分享文献 是一篇10Xvisium call mutation的文章，值得大家借鉴。 多组学是未来的...
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SY日记方法分享--高精度空转（Xenium、CosMx）距离度量作者，Evil Genius 今天我们分享方法论。 参考文献 其中分析内容很多，但是这一篇我们主要关注距离分析。 现在基本上空转分析全部是python代码，大家最好还是上手一...
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SY日记--HD数据识别保守的空间结构作者，Evil Genius 很多人问我这些空转的分析内容都是怎么总结的，其实没啥秘密，天天做项目，看文献，被老师骂，总结出来的。 今天我们需要实现的目标 解析一下这个步骤，...
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SY日记--10X HD的CNV分析作者，Evil Genius 世事无常，父辈们也开始了。 无论发生什么，只要人在，一些就还有希望。 今天我们更新脚本，HD分析CNV 其中借助的也是inferCNVpy，但是...
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SY日记--高精度空转（Xenium、CosMx）热点通讯区域分析作者，Evil Genius SY第一天，无论发生什么，依然热爱生活。 今天我们更新脚本，实现高精度的通讯热点区域分析。 分析原理很简单 大家在划分高精度的ROI的时候，这个...
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脚本更新--空间背景对基因表达影响的评估作者，Evil Genius 11月的最后一天了，马上过年了，大家还好么？ 现在各行各业都很卷，而且处于通缩的情况，按照一些专家的推断，通缩之后就是大萧条，我们这种普通人该怎...
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脚本更新---高精度（Xenium、CosMx）的邻域通讯分析作者，Evil Genius 维权路漫漫，且行且珍惜。 今天我们更新脚本，高精度（Xenium、CosMx）的邻域通讯分析 python代码，python大家尽量学一学，如何...