Cutadapt安装 基本命令 例子: 常用参数 参数详解 Removing adapters Adapter 移除 Anchored 5’ adapters:adapter...
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弄完我才知道为何很多人吐槽这个软件的Linux版本很难用,各种报错都是泪呀。大概正确的安装和运行操作如下,很多教程遇到的坑我就不写了。 首先去maxquant的官网去获得ma...
MUMmer出现的历史背景测序技术刚开始发展的时候,大家得到的序列都是单个基因的长度,所以一般都是逐个基因的比较,用的都是BLAST或FASTA通过逐个基因联配的方式搜索数据...
关于该软件的计算可选参数以及结果文件的解读,见前三篇分享: 序列比对软件 MUMmer 快速上手(一)[https://www.jianshu.com/writer#/not...
一:下载安装 二:下载数据库 三: 确定待查询的核苷酸序列或基因组的大小,作为后续命令的参数 其输出结果中有一行,Total # of residues: 218502668...
快速上手的话见上一篇,这篇详细介绍一下 MUMmer 4 软件下 nucmer 程序的详细参数。 序列比对软件 MUMmer 快速上手(一)[https://www.jian...
如何使用MUMmer比对大片段序列 测序技术刚开始发展的时候,大家得到的序列都是单个基因的长度,所以一般都是逐个基因的比较,用的都是BLAST或FASTA通过逐个基因联配的方...
这是我2022-02-16在CGM分享的文字稿 从2016年,我开始自学生物信息,那个时候,为了加深自己学习,所以就不间断的在网上分享我的学习笔记。 我有一个自己的博客,xu...
许多基因组的文章里都会提到使用PAML进行基因的正选择分析(positive selection), 网上也有一些教程介绍如何用PAML进行分析。无论是文章,还是教程,大多只...